Την αντίθεσή του στον διαχωρισμό κράτους και Εκκλησίας, εξέφρασε ο πρόεδρος των Ανεξάρτητων Ελλήνων, Πάνος Καμμένος, κατά την ομιλία του στην προ ημερησίας διάταξης συζήτηση στη Βουλή για την Παιδεία.
«Το Σύνταγμα είναι δεδομένο, αναφέρεται στους άρρηκτους δεσμούς με την Εκκλησία και από την στιγμή που υπάρχει αυτό δεν υπάρχει κανένας λόγος να ξεκινήσει συζήτηση για χωρισμό Εκκλησίας και κράτους», είπε χαρακτηριστικά ο κ. Καμμένος και συνέχισε, αναφερόμενος στον κ. Φίλη: «Μπορεί να έχουμε διαφορές που τις εκφράζουμε και δημόσια καμιά φορά με τον υπουργό Παιδείας Νίκο Φίλη για τα Θρησκευτικά, αλλά φέτος μετά από πολλά χρόνια στα σχολεία πήγαν και βιβλία και εκπαιδευτικό προσωπικό».
Απέρριψε την πρόταση του επικεφαλής του Ποταμιού Σταύρου Θεοδωράκη για ναούς στους προσφυγικούς καταυλισμούς.
Παράλληλα, επανήλθε στις καταγγελίες για την κ. Ζευγώλη που ήταν διευθύντρια του γραφείου του υπουργού και βουλευτή της Ν.Δ. Χρήστου Σταϊκούρα και διορίσθηκε στην Τράπεζα Αττικής.