Στην αντεπίθεση έχει περάσει το Φανάρι για όσα της καταμαρτυρεί η Ρωσική Εκκλησία. Μετά το "σκασίλα μου" του Βαρθολομαίου γιατί δεν τον μνημονεύουν οι Ρώσοι, μιλώντας πριν από λίγες μέρες σε Ουκρανούς δημοσιογράφους παραδέχτηκε με τον πιο επίσημο τρόπο ότι «το όνειρο των αδελφών μας των Ρώσων είναι να έχουν την ηγεσία της ορθοδοξίας. Αυτό δεν πρόκειται να γίνει ποτέ».
Ο κ.Βαρθολομαίος επιτέθηκε στη Μόσχα και για την απουσία της από την Πανορθόδοξη της Κρήτης το 2016 ,μια ενέργεια που σηματοδότηση της έναρξη μιας κόντρας που συνεχίζεται:
«Οι αδελφοί μας οι Ρώσοι λένε ότι έγινε “σχίσμα”. Δεν υπάρχει σχίσμα. Εάν υπάρχει σχίσμα, το έκαναν εκείνοι, διακόπτοντας την Κοινωνία με τέσσερις Εκκλησίες. Αυτό το “σχίσμα” ξεκίνησε από πλευράς Ρωσίας το 2016, όταν η Εκκλησία της Μόσχας και -με την επίδρασή της- άλλες τρεις Εκκλησίες, δεν ήρθαν στην Αγία και Μεγάλη Σύνοδο της Κρήτης». Μάλιστα ο ίδιος πρόσθεσε ότι η Μόσχα συμμετείχε στην προετοιμασία της Συνόδου μέχρι τελευταίας στιγμής:
«Αυτή την Σύνοδο την ετοιμάσαμε όλοι μαζί. Μέχρι και τον Ιανουάριο του 2016 στη Γενεύη, που είχαμε την τελευταία σύναξη των Ορθοδόξων Προκαθημένων, όλες οι Εκκλησίες, και οι Ρωσία, ετοιμάζαμε αυτή την Σύνοδο. Και την τελευταία στιγμή οι Ρώσοι και άλλες τρεις Εκκλησίες δεν ήρθαν.Προφανώς δεν ήθελαν στην πραγματικότητα να πραγματοποιηθεί μια τόσο σπουδαία Σύνοδος υπό την προεδρία του Οικουμενικού Πατριάρχου» .
Για την δράση της ρωσικής εκκλησίας τόσο στην Ουκρανία όσο και στα Βαλκάνια ο κ.Βαρθολομαίος χρησιμοποίησε σκληρή γλώσσα :«Το όνειρο των αδελφών μας των Ρώσων είναι να έχουν την ηγεσία της Ορθοδοξίας. Αυτό δεν πρόκειται να γίνει ποτέ διότι οι Κανόνες της Ορθοδόξου Εκκλησίας και η πράξη της Εκκλησίας -δια μέσω των αιώνων- το πρωτείο το έχουν δώσει στον Κωνσταντινουπόλεως. Κωνσταντινούπολη θα είναι πάντα πρώτη Εκκλησία, εις το σύστημα των Ορθοδόξων Εκκλησιών, και η Αδελφή Ρωσική Εκκλησία θα είναι πέμπτη.μείς δεν έχουμε πρόβλημα με τους Ρώσους. Είναι παιδιά της Κωνσταντινουπόλεως".
Επίσης ,απάντησε και για τις κατηγορίες των Ρώσων περί Παπισμού:
«Με υβρίζουν οι Ρώσοι αδελφοί μας λέγοντας ότι έχω παπικές αξιώσεις και τα λοιπά. Αυτά τα συγχωρώ, τα αντιπαρέρχομαι, ειλικρινα δεν με ενδιαφέρουν, τι θα πουν ο Μητροπολίτης Βολοκολάμσκ, ο Αντώνιος Μπορίσπολ και οι άλλοι. Ας πούνε ό,τι θέλουν. Αυτό που μας ενοχλεί είναι όταν αμφισβητούνται τα δικαιώματα και τα προνόμια του Πατριάρχη Κωνσταντινουπόλεως, του Θρόνου της Κωνσταντινουπόλεως. Διότι αυτά μας τα έδωσαν οι Οικουμενικές Σύνοδοι, δεν τα πήραμε μόνοι μας. Σε αυτά όταν τα αμφισβητούν οι Ρώσοι είναι αγνώμονες και είναι αδιάβαστοι».