Από την στιγμή που ο Κυριάκος Μητσοτάκης δεν τον έχρισε αντιπρόεδρο της ΝΔ, όπως λεει ο ίδιος ότι του το είχε υποσχεθεί, Απόστολος Τζτζικώστας βγήκε στο «αντάρτικο» και με συνεντεύξεις και δηλώσεις παίρνει ξεκάθαρες αποστάσεις από τον πρόεδρο της ΝΔ. Παράλληλα ο περιφερειάρχης Κεντρικής Μακεδονίας έχει επαφές με στελέχη της ΝΔ στην Βόρεια Ελλάδα με στόχο να δημιουργήσει ισχυρούς «γαλάζιους» πυρήνες στις περιοχές που ο ίδιος έχει σημαντικά ερείσματα κάτι που φάνηκε και στις εσωκομματικές εκλογές.
Σύμφωνα με πληροφορίες σε μία από τις συναντήσεις που είχε ο Απόστολος Τζιτζικώστας με τον Κυριάκο Μητσοτάκη στα γραφεία του κόμματος στην Συγγρού, συμφωνήθηκε να αναλάβει ο βορειοελλαδίτης πολιτικός την αντιπροεδρία και θα είναι αρμόδιος για την περιφερειακή ανάπτυξη.
Στην συνέχεια ακολούθησαν διαρροές από την Συγγρού για πέντε θέσεις αντιπροέδρων κάτι που ενόχλησε τον Απόστολο Τζιτζικώστα καθώς είναι γνωστό πως στήριξε τον Κυριάκο Μητσοτάκη στον δεύτερο γύρο για την προεδρία της ΝΔ.
Ωστόσο ο Άδωνις Γεωργιάδης που συγκέντρωσε πολύ μικρότερο ποσοστό έγινε αντιπρόεδρος, ενώ ο ίδιος όχι. Την οριστική απόφαση του προέδρου της ΝΔ την πληροφορήθηκε ο περιφερειάρχης λίγες ημέρες πριν από το συνέδριο του κόμματος.
Ο Απόστολος Τζιτζικώστας δεν έκρυψε την έντονη απογοήτευση του και μία από τις αποφάσεις που πήρε ήταν να κόψει τις γέφυρες επικοινωνίας με τον Κυριάκο Μητσοτάκη, όπως και τις συχνές του επισκέψεις στην Συγγρού. Παράλληλα άρχισε τις παρεμβάσεις σε μέσα της Β. Ελλάδας και στην συνέχεια ακολούθησαν συνεντεύξεις σε πανελλαδικά έντυπα.
Η τελευταία διαφοροποίηση του αφορούσε τον τρόπο εκλογής του προέδρου της Δημοκρατίας που υποστήριξε ότι θα πρέπει να γίνεται από τον λαό σε αντίθεση με τα όσα έχει δηλώσει ο πρόεδρος του κόμματος.
Αξίζει να υπενθυμίσουμε πως και ο Αντωνης Σαμαράς είχε συγκρουστεί με τον Απόστολο Τζιτζικώστα και αυτό είχε σαν αποτέλεσμα η ΝΔ να χάσει μετά από χρόνια την περιφέρεια κεντρικής Μακεδονίας, την οποία κέρδισε εύκολα ως ανεξάρτητος αφήνοντας δεύτερο και καταϊδρωμένο τον Γιάννη Ιωαννίδη.